COVID-19 en Openstreetmap
Openstreetmap is ‘de wikpedia van landkaarten’. Iedereen kan gegevens toevoegen, niet alleen straten en huizen, maar ook allerlei andere data: bushaltes, rolstoelvriendelijkheid van restaurants, en ook gegevens over besmettelijke ziektes zoals COVID-19.
De fabrikant van ‘slimme’ thermometers Kinsa, heeft meer dan een miljoen thermometers verkocht in de US, en kan de temperatuur daarvan aflezen. Zij gebruiken openstreetmap om de gegevens te presenteren en zo zie je in welk gebied ‘de temperatuur flink oploopt’. (tinyurl.com/tlhduks).
Ook Healthmap gebruikt openstreetmap om de verspreiding van het Coronavirus te visualiseren. In samenwerking met Harvard Medical School en Boston Children’s Hospital publiceren zij een dataset van publiek beschikbare gegevens van overheden en researchers over de hele wereld. Iedereen kan die dataset gebruiken voor eigen onderzoek (open data). (healthmap.org/covid-19).
Het Humanitarian Openstreetmap Team (HOT) heeft een uitgebreide handleiding om te leren hoe je zelf, thuis, kan helpen met het verzamelen van gegevens over COIVID-19. Het localiseren van ziekenhuizen, apotheken, en het toevoegen van openingstijden en andere gegevens kan helpen! (tinyurl.com/uexc9k9).
Open source beademing!
Een gevolg van besmetting met het Coronavirus kan zijn dat de patient beademd moet worden. Daarvoor is apparatuur nodig en die is er niet genoeg.
Een groep van meer dan 300 ingenieurs, ontwerpers, technici en programmeurs startten een actie op Facebook met als doel een beademings-ventilator te bouwen met behulp van eenvoudige en beschikbare materialen, 3D-printers en open source hardware. In zeven dagen bouwden ze een prototype dat kan dienen als oplossing voor het wereldwijde tekort aan ventilatoren.
Een andere groep in Italië maakte ventielen voor beademingsapparatuur met een 3D printer. Het bedrijf dat deze ventielen maakt, wilde de specificaties niet openbaar maken en de groep vrijwilligers moest er zelf maar achter zien te komen hoe het ventiel omgezet kon worden naar een 3D model. Daarom is het belangrijk dat de bouwtekeningen van medische apparatuur vrij beschikbaar zijn.
De Summit Supercomputer heeft mogelijk een aantal chemische componenten gevonden die het virus kunnen tegenhouden. Uiteraard is het operating system van dit rekenwonder open source: Red Hat Enterprise Linux.
Het open source lab automatiserings platform van Opentrons bestaat uit open source hardware, geverifiëerde labware, verbruiksartikelen, reagentia en werkstations. Opentrons zegt dat haar producten de COVID-19-tests drastisch kunnen opschalen met systemen die tot 2400 tests per dag aankunnen, met een aanlooptijd van vier weken.
CHIME helpt ziekenhuizen met hun planning, door informatie over de capaciteit en de bevolkingsgrootte in te voeren en vervolgens aannames rond de verspreiding en het gedrag van COVID-19 te analyseren. Managers kunnen een standaard SIR-model gebruiken om het aantal nieuwe ziekenhuisopnames per dag te projecteren. Ze kunnen ook de beste en slechtste scenario’s maken om te helpen bij de capaciteitsplanning.
Open Source Saves Lives!
tinyurl.com/txlr773 / tinyurl.com/yx5u9n7j / tinyurl.com/rfdw38s / tinyurl.com/wtp58rx
wiki: summit supercomputer
opentrons.com / github.com/Opentrons
penn-chime.phl.io
Corona
Het COVID-19 virus, ofwel ‘corona’ is een wereldwijde epidemie (een pandemie). Wetenschappers bestuderen het virus om een vaccin te vinden en dat doen ze met… open source.
IDSeq (Infectious Disease Sequencing Platform) is een open source ‘DNA-scanner’. Het is een wereldwijd software platform om het DNA van viri te scannen en informatie te verzamelen die helpt om die te neutraliseren. IDSeq valt onder het Chan Zuckerberg Initiative, van het echtpaar Chan-Zuckerberg (de eigenaar van Facebook).
Ook Bill en Melinda Gates (van Microsoft) doen mee, en geven geld voor kleine scanners die artsen mee kunnen nemen in het veld. Als een infectie wordt geconstateerd kan het bloed van de patient gescand worden en de resultaten worden in de cloud gezet via Internet. Daar komen ze in een grote database terecht die iedereen kan doorzoeken.
Dat doorzoeken gebeurt steeds meer door Kunstmatige Intelligentie (AI) en Deep Learning software, die veelal ook open source is.
Naast de Chan-Zuckerberg Biohub is er ook een organisatie die vanuit Parijs werkt: Just One Giant Lab (JOGL). Dit initiatief deelt software, methodieken, data en resulaten wereldwijd (open source en open research). Speciaal voor COVID-19 is er een Open Lab Notebook waar alle bevindingen in te vinden zijn. Artsen, epidemologen: U kunt daar direct zelf informatie aan toevoegen!
Er is een overzicht van alle open source COVID-19 initiatieven te vinden op tinyurl.com/th6j3nt en Openstreetmap wordt veelvuldig gebruikt om de verspreiding van het Corona virus te registreren.
Genoeg aanleiding om open source serieus te nemen bij de bestrijding van Corona en andere infectieziekten!
idseq.net
github.com/chanzuckerberg/idseq-dag
tinyurl.com/regvco2
app.jogl.io/project/118
tinyurl.com/yx65tsaf
healthmap.org/covid-19
mapbox.cn/coronavirusmap
OpenSCAD voor 3D modeleren
OpenSCAD is software voor het maken van 3D CAD-objecten. Het is open source, en gratis beschikbaar voor Linux, Windows en MacOS. (CAD: Computer Assisted Drawing)
In tegenstelling tot de meeste open source software voor het maken van 3D-modellen (zoals het veelgeprezen Blender), richt OpenSCAD zich op de CAD-aspecten van het ontwerp in plaats van de artistieke aspecten. Dit kan dus de toepassing zijn waar u naar op zoek bent wanneer u van plan bent 3D-modellen van machineonderdelen te maken, maar waarschijnlijk niet de juiste keuze voor het maken van 3D animaties of films.
OpenSCAD biedt twee modelleringstechnieken: ten eerste is er CSG (Constructieve Solide Geometrie) en ten tweede is er extrusie van 2D-contouren. Extruderen is een vormgevingstechniek waarbij een vervormbaar materiaal (zoals plastic) door een mal geperst wordt. In de mal zitten één of meerdere complex gevormde gaten die het uiteindelijke staafmateriaal, het extrusieprofiel, vormt. Voor het formaat van de databestanden worden Autocad DXF-bestanden gebruikt. Naast DXF-bestanden kan OpenSCAD 3D-modellen lezen en maken in STL en OFF dataformaat, twee gangbare bestandsformaten voor 3D modellen.
OpenSCAD werkt dus op alle soorten computers, is gratis, en kan 3D modellen maken in bestandsformaten die begrepen kunnen worden door 3D printers, lasersnijders en CNC-freesmachines.
Und’e kabes ta?
Absoluut de topper van het Karnaval 2020 is de app ‘Und’e kabes ta?’.
Als je deze app op je telefoon installeert kun je precies zien waar de kop (kabes) van de carnavalsstoet zich bevindt. En dat is heel handig, want je weet maar nooit wanneer de optocht van start gaat. Wil je weten hoe laat de stoet in ‘Hanchi Polar’ aankomt? Gewoon even op je telefoon kijken en je ziet direct waar ze zijn. Ook de achterkant van de parade wordt netjes aangegeven.
Complimenten voor ICTUAL, het bedrijf dat deze app heeft gemaakt. De app zelf is helaas geen open source, voor zover ik kon nagaan, maar maakt wel gebruik van Openstreetmap, de open source kaart van de hele wereld.
Openstreetmap is de ‘wikipedia’ van landkaarten. Iedereen kan als vrijwilliger de kaart intekenen. Dat gebeurde ook op Curaçao in 2013. De Openstreetmap-expert Milo van der Linden kwam naar Curaçao en tekende met 12 leerlingen en 5 docenten, in drie dagdelen, het Rifgebied te Otrobanda in. Daarna zijn er vele vrijwilligers van over de hele wereld bezig geweest om de kaart aan te vullen. Alle gebouwen en straten die je in de app ziet zijn door gewone mensen, zoals U en ik, op de kaart gezet.
Als je hetzelfde gebied op Google Maps bekijkt, zie je geen enkel gebouw en sommige straten zijn half afgemaakt. Bovendien kost Google Maps geld voor elke keer dat je er gebruikt van maakt. De makers van de app hebben dus flink bespaard door Openstreetmap te gebruiken.
Nog lang niet alle wegen en gebouwen zijn ingevuld. Maar het is relatief eenvoudig om een wijk of de omgeving van een school of bedrijf in te tekenen. En hartstikke leuk! Wordt het niet eens tijd dat we heel Curaçao op de kaart zetten?
IRMA – Identiteit en Privacy
Als je een rekening bij de bank opent, moet je je geboortedatum opgeven, en of je man of vrouw bent. Waarom eigenlijk?
Misschien is het handig om een brief te kunnen beginnen met ‘Dhr’ of ‘Mevr’. Maar het is vast ook handig om alleen mannen tussen 40 en 45 een folder toe te sturen voor een lening om een sportauto te kopen.
Is je geboortedatum echt nodig om een bankrekening te openen? Eigenlijk niet, zolang je je kan identificeren (bijvoorbeeld met je paspoort). Om je identiteit vast te stellen is een geboortedatum niet nodig.
Zo’n stukje persoonsgegeven noemen we een ‘attribuut’. IRMA is ontwikkeld om die persoonsgegevens te beschermen en alleen maar informatie te geven die echt nodig is. Zo geeft IRMA antwoord op de vraag: ‘is deze persoon ouder dan 65’ maar zonder de geboortedatum vrij te geven. Je kiest dan zelf om een bepaald attribuut wel of niet aan een bank, zorgverzekeraar, of webwinkel te geven.
IRMA staat voor: I Reveal My Attributes. IRMA stelt je in staat om online, via een app op je smartphone, bepaalde attributen wel te laten zien (“ouder dan 65”), maar ook om andere attributen juist niet te laten zien (geboortedatum, geslacht, of telefoonnummer). IRMA beschermt daarmee je privacy.
De gemeente Nijmegen heeft een groep inwoners de mogelijkheid gegeven om hun gegevens uit de Basisregistratie Personen op te vragen en deze te gebruiken voor hun ‘digitale identiteit’ in de Irma-app. Door in te loggen met Irma hoeft iemand geen gebruikersprofielen meer aan te maken op allerlei websites en apps.
IRMA is ontwikkeld door de stichting ‘Privacy by Design’ van hoogleraar Bart Jacobs van de Radboud Universiteit. IRMA is open source, zodat niet alleen je attributen geheim blijven maar iedereen kan controleren dat de sofware geen achterdeurtjes bevat.
irma.app
privacybydesign.foundation
tinyurl.com/u6zzrte
github.com/privacybydesign
Common Ground
Terwijl in Curaçao het gebruik van Open Source en Open Data nog nauwelijks bespreekbaar is, worden er in Nederland grote stappen gezet. ‘Common Ground’ (gemeentegrond) is een initatief van de Vereniging Nederlandse Gemeenten (VNG) om een nieuwe, moderne, gezamenlijke informatievoorziening te creeéren voor het uitwisselen van gegevens.
Het huidige systeem werkt niet goed, want dat is gebaseerd op vele verschillende closed source oplossingen die in elke gemeente weer anders zijn en een goede uitwisseling van gegevens in de weg staan. En dat heeft een negatief effect op de gemeentelijke dienstverlening.
Om beter met gegevens om te kunnen gaan, wordt data gescheiden van software, en slechts 1 keer opgeslagen. Bovendien is de data ‘open’ in zoverre de privacywetgeving dit toelaat.
Er wordt gezamenlijk software ontwikkeld, die door alle gemeentes gebruikt kan worden, zodat niet iedere gemeente zijn eigen (dure) software hoeft te maken. Daarbij wordt zoveel mogelijk software open source gemaakt, waardoor er transparantie ontstaat en waardoor de markt niet meer dicteert wat wel en niet kan, en de prijzen lager worden. Het ‘vendor lock-in’ principe wordt daarmee gedwarsboomd wat leidt tot goedkopere en veiligere software, die door verschillende partijen onderhouden kan worden.
Men werkt via ‘agile’ softwareprincipes, waarbij steeds kleine stapjes genomen worden naar een eindproduct, in plaats van enkele jaren aan een nieuwe versie te werken die dan ingevoerd moet worden en tot veel chaos leidt.
Dit is in ons land ondenkbaar!
Neem de software van de belastingdienst, die gebouwd wordt door 1 bedrijf, dat zoveel mogelijk de regie naar zich toetrekt waardoor elke wijziging alleen door dat bedrijf gedaan kan worden, en de belastingdienst zich blauw betaalt. En als de belastingdienst zich blauw betaalt, doen wij dat ook.
LibreTaxi: OpenUber
Uber is een platform om chauffeurs in contact te brengen met mensen die
een ritje nodig hebben. Dat doen ze via een app, en van elke rit pikken
ze een graantje mee. Net als Airbnb, die verhuurders van
(vakantie)woningen in contact brengt met reizigers en andere
(vakantie)woningzoekenden. Het is een idee dat in de praktijk heel goed
werkt, en hoewel Airbnb op Curaçao ruim vertegenwoordigd is, ontbreekt
elk spoor van Uber. Eén van de redenen is de kleine markt – er valt niet
veel te verdienen aan ons eilandje. Commercieel niet interessant.
Een alternatief voor Uber is Lyft. Lyft is net als Uber: geen open
source. Maar Uber draagt wel veel bij aan Open Source, net als Lyft.
Voor wie het nog niet doorheeft: Alle (!) grote bedrijven dragen bij aan
open source. Als IT-er hoef je echt niet te solliciteren als je geen
kennis van open source hebt. Denk daaraan als je in de opleiding zit, en
als je docenten je geen informatie geven, dan kan je het makkelijk
opzoeken op Internet. Lyft is ook niet te vinden op Curaçao.
Gelukkig is er een open source platform voor ‘ridesharing’. Dit heet
LibreTaxi. Dowload de app en begin je eigen ‘Uber/Lyft’ op Curaçao! Een
nadeel is dat LibreTaxi alleen met cash geld werkt. Wellicht komt er in
de toekomst een mogelijkheid om met Credit Card of Bitcoin te betalen.
Dat is minder risicovol voor de chauffeurs. LibreTaxi is open source,
dus je kan de source code downloaden en aanpassen, en er een Curaçaose
aangelegenheid van maken, met vertalingen in het Papiaments, valuta in
ANG, alle buurten in een dropdownlijst en dat soort dingen.
Wie gaat de uitdaging aan?
Open Statistieken
De meeste mensen hebben een hekel aan het vak statistiek als ze gaan studeren.
Toch heeft bijna iedereen die een wetenschappelijk onderzoek doet statistiek nodig. Ook de overheid, het bedrijfsleven en natuurlijk het CBS. Daarom wordt er op HBO-opleidingen veel aandacht aan besteed. Er zijn verschillende soorten statistiek en dus ook verschillende softwarepaketten.
Het meest gebruikt is het gesloten pakket ‘SPSS’. Dit programma wordt op veel hogescholen gebruikt, geleend, en gekopieerd. Het is een krachtig programma maar helaas geen open source, en de data wordt niet opgeslagen in een open standaard.
Met andere woorden, als je eenmaal in SPSS werkt kan je niet makkelijk overstappen, en ook gegevens van anderen kan je alleen maar gebruiken als je zelf ook SPSS koopt. En dat is best duur, rond de 1400 USD (maar er zijn wel kortingen voor de educatieve sector).
De open source tegenhanger heet… PSPP. Het kan ongeveer hetzelfde als SPSS maar het is gratis en open. Andere open source pakketten zijn gretl, R, en de meer algemene wiskundepakketen zoals SAGE.
Op Wikipedia staat een mooie lijst met open en gesloten statistische software, waarbij vooral opvalt dat de gesloten pakketten vaak erg duur zijn. Het pakket ‘R’ biedt veel meer mogelijkheden voor statistische analyse, terwijl PSPP veel op SPSS probeert te lijken.
Voor studenten is de aanschaf van SPSS vaak te duur en sinds kort beveelt de UNA het open source pakket PSPP aan. In combinatie met LimeSurvey, eveneens open source, biedt het voor onderzoek twee gratis, maar kwalitatief goede tools.
Studeren wordt opeens goedkoper!
Open Source in 2013
Dit stond er op deze plek op januari 2013:
‘Aan het begin van het jaar is het tijd om koffiedik te kijken en gelukkig is open source makkelijk te voorspellen, want in 2013 zal er alleen maar meer van gebruikt worden. Meer mensen zullen bekend raken met het concept ‘open’ en nog veel meer mensen zullen het gebruiken zonder dat ze het weten, in smartphones, routers, websites en social media platforms.
Dat komt omdat open source zo’n succesvolle ontwikkelstrategie is gebleken. [..]
Dat betekent dat een startende ondernemer binnen een hele korte tijd en zonder financiering kan beginnen met het maken van op maat gemaakte software. [..] Een startend bedrijf dat van deze globale trend gebruik wil maken, moet natuurlijk wel personeel kunnen vinden dat in deze techniek de weg weet.
Op Curaçao is er helaas geen opleiding of beleid om zo snel mogelijk aan te sluiten bij deze ontwikkeling, en ik voel dat beleidsmakers, strategen en financiers nog niet overtuigd zijn [..] Open source is een disruptive technology die oude structuren omverwerpt en nieuwe manieren van werken en geld verdienen mogelijk maakt.
Mijn voorspelling is dat we dit jaar wel een beetje bewuster zullen worden, maar nog niet echt aan een inhaalslag kunnen beginnen, tenzij de overheid open source in haar beleid opneemt, zoals in Nederland in 2002 al gebeurd is.’
We zijn nu 7 jaar verder, en wat is er veranderd in de wereld, en wat is er veranderd op Curaçao? Alle grote bedrijven, inclusief Microsoft, gebruiken én maken Open Source Software.
Op Curaçao heeft de overheid nog steeds geen beleid en er zijn nog steeds geen opleidingen die aansluiten op de wereldmarkt.
We lopen met ons allen meer dan 10 jaar achter.
Rest mij nog om u een gelukkig… 2010… te wensen!