Open Kanker Medicijn
Jay Bradner, werkzaam aan het Dana-Farber Cancer Institute in Boston, heeft met zijn team een mogelijk medecijn tegen bepaalde soorten kanker ontdekt.
Het Dana-Farber Instituut is een academisch instituut en dus geen onderdeel van de commerciële farmaceutische onderzoekslaboratoria.
In tegenstelling tot deze op winst gerichte laboratoria vroeg Bradner geen patent aan op het door zijn team ontdekte molecuul ‘JQ1’, maar emailde de chemische beschrijving naar 40 andere academische en commerciële onderzoeksfaciliteiten.
Open Source Farmacie, zeg maar.
Over de hele wereld begonnen wetenschappers en onderzoekers te kijken naar het molecuul. Een groep in Oxford beschikte over de techniek om een driedimensionaal beeld van het molecuul te maken (of in ieder geval een tweedimensionale projectie ervan) en stuurde die op naar Bradner. Deze kreeg daardoor snel meer inzicht in hoe het molecuul werkte.
Op die manier werkten diverse wetenschappers mee aan het ontstaan van wat mogelijk een effectieve behandeling tegen kanker kan worden. Er is echter nog een lange weg te gaan om dit molecuul te verwerken in een – uitvoerig getest – medicijn. Een deel van dat proces zal veel geld kosten, maar Bradner toont hiermee aan dat een open source model voor het ontwikkelen van medicijnen wel degelijk zoden aan de dijk zet.
Inzichten komen van verschillende kanten in plaats van de geïsoleerde groep onderzoekers die toevallig bij een farmaceutisch bedrijf werken.
Het Dana-Farber Cancer Institute heeft ook een afdeling die zich richt op de ontwikkeling van Open Source software die de analyse en interpretatie van genoom gegevens verbeterd, met als doel die vrij te verspreiden onder de wetenschappelijke gemeenschap.
http://www.ted.com/talks/jay_bradner_open_source_cancer_research.html
http://www.dana-farber.org
http://cccb.dfci.harvard.edu/
Open Facebook
Eén van de succesvolste bedrijven op het Internet is Facebook Incorporated (FB).
Het bedrijf bestaat pas zeven jaar, heeft 800 miljoen gebruikers, en is meer dan 50 miljard US Dollar waard.
Het bedrijf is ‘vanaf de grond’ opgebouwd met Open Source software.
FB participeert in tal van Open Source projecten zoals Apache, MySQL, en PHP. De verbeteringen die het bedrijf aanbrengt worden weer vrijgegeven aan de wereld.
Hoe kan een bedrijf dat geheel op gratis software is gebaseerd zo ontzettend kapitaalkrachtig worden? Hoe kan het zijn, dat er software gebruikt wordt zonder ‘support contract’?
Is eigenaar Mark Zuckerberg (27 jaar jong) niet bang dat zijn hele bedrijf in elkaar stort omdat hij niemand kan bellen als er een probleem ontstaat? Nee, natuurlijk niet.
Want ten eerste weet Zuckerberg dat Open Source software vaak beter werkt dan Closed Source software; en ten tweede heeft hij een heel leger van slimme mensen die intussen meer van de software afweten dan wie dan ook.
Yu di Kòrsou zijn slim. Ze behalen aanzien en prijzen in de hele wereld op welk gebied dan ook. Best kans dat er een Yu’Korsou werkt bij Facebook, Google of Yahoo. Daarom zou de overheid een voorbeeld moeten nemen aan bedrijven zoals Facebook.
Huur een heel leger aan slimme mensen en schakel over op Open Source software. Verbeter wat verbeterd moet worden en geef terug aan de wereld. Verlaag de kosten voor IT-projecten met 90%, breng transparantie in alle overheidsprocessen, voorzie de burger van gratis software.
Als FB haar hele bestaan op Open Source baseert, waarom zou een land dat niet kunnen?
Misschien is men bang voor ‘Open’, of misschien zijn we er nog niet aan toe. Een keuze voor Open Source brengt kosten naar beneden, schept hooggekwalificeerde banen, en vergroot de transparantie. “Doen!”, zou ik zeggen.
Zelf doen!
https://developers.facebook.com/opensource/
http://www.baudlabs.com/archives/988
http://code.google.com/opensource/
Software Freedom Day
Free Software is software die legaal gekopiëerd mag worden. Software die je dus weg mag geven.
Dit in tegenstelling tot Proprietary Software, waarvoor een gebruikerslicentie gekocht moet worden, meestal voor elke computer waarop de software gebruikt wordt.
Free Software mag ook aangepast worden en dat kan, omdat de broncode beschikbaar is. De aanpassingen mogen ook weer verspreid worden. Zo ontstaat een steeds beter product waar vele mensen aan gewerkt hebben vanuit verschillende belangen.
Grote bedrijven zoals IBM, Facebook, Google en Microsoft werken aan Free Software. Deze bedrijven investeren tegenwoordig miljarden in Free Software. Ze verwerken Free Software in hun eigen producten waardoor de ontwikkelkosten en onderhoudskosten drastisch omlaag gaan.
Ook het veilig houden van de software (veiligheidslekken en dergelijke) wordt gedeeld met een grote gemeenschap van gebruikers en programmeurs. Daardoor hoeft niet ieder bedrijf een groep technici beschikbaar te houden voor elk product. Ook is het makkelijker verschillende taalversies van een product te maken.
Software Freedom Day wordt sinds 2005 wereldwijd elk jaar gevierd, dit jaar zelfs in meer dan driehonderd plaatsen. In Curaçao wordt sinds 2009 aandacht besteed aan Software Freedom Day. Ook dit jaar wordt er weer een klein evenement georiganiseerd. De pas opgerichte ‘Fundashon Kòrsou Habri’ presenteert zichzelf op zaterdag 17 september vanaf 17:00 in Cocktailbar El Ron, Roodeweg 86, Colon/Otrobanda.
Tevens wordt, in samenwerking met FPI, de eerste open source spellchecker gelanceerd, die gebruikt kan worden met OpenOffice/LibreOffice.
www.softwarefreedomday.org
www.softwarefreedomday.eu
www.opencuracao.com
Linux voor de UoC
Een groep Braziliaanse oceanologen ontwikkelde een speciaal op de wetenschap gerichte versie van Linux. Deze DVD bevat een schat aan open source programma’s waar studenten, professoren en docenten veel aan kunnen hebben.
Brazilië is een voorloper op het gebied van Open Source ontwikkeling.
Poseidon – zoals de oceanologen deze versie noemden – is een DVD die in elke PC gebruikt kan worden zonder dat er een installatie nodig is. Dus je geliefde Windows 7 systeem blijft onaangetast terwijl je deze ‘live-DVD’ gebruikt.
Poseidon levert een gebruiksvriendelijke desktop met alle ‘gewone’ kantoorprogramma’s zoals LibreOffice (tekstverwerker, spreadsheet, presentatie, database). Ook kan er makkelijk van het Internet gebruik gemaakt worden (browser, emailprogramma, enzovoort).
Maar de echte toegevoegde waarde zit hem natuurlijk in de wetenschappelijke software. Verschillende pakketten zijn beschikbaar voor GIS, 3D Visualisatie, wiskunde, statistiek, genetica, bio-informatica en vele andere onderzoeksgebieden.
Op het gebied van Geografische Informatie Systemen (GIS) zijn er maar liefst zeven pakketten aanwezig, waaronder het wereldwijd veel gebruikte GRASS. OpenDX (van IBM) staat er ook op voor 2/3/4D visualisatie van scalar, vector en tensor velden.
Voor statistiek is er ‘R’, vergelijkbaar met SPSS. QCAD levert 2D AutoCAD mogelijkheden en Blender kan gebruikt worden voor 3D modelling en animaties.
Voor wetenschappelijke publicaties (met veel formules, grafieken en dergelijke zaken die onmogelijk zijn te maken met een gewoon Office pakket) is er Kile en Lyx, die op LaTeX gebaseerd zijn. LaTeX is een internationaal geaccepteerde standaard voor opmaak van wetenschappelijke documenten.
Verder zijn er vier programma’s om data te plotten en daarnaast nog een aantal audiovisuele software pakketten.
De UoC zou in het introductiepakket van elke student de Poseidon DVD weg kunnen geven – de kosten zijn verwaarloosbaar en studenten beginnen hun studie met een uitgebreid pakket aan software waar ze anders duizenden guldens voor zouden moeten betalen.
Project Planning
Het meest gebruikte pakket voor project planning is ongetwijfeld Microsoft Project. En het meest gebruikte onderdeel daarvan is waarchijnlijk de Gannt-kaart.
Als u veel projecten plant, kent u die wel: een tijdbalk met daarin per project een overzicht van alle fases, taken, beschikbare bronnen en de deadlines, deliverables, mijlpalen en natuurlijk de datum van afronding. Vanuit die tijdbalkjes kan je inzoomen op individuele taken en voortgangsstatistieken.
Al lange tijd had ik behoefte aan een dergelijk programma, maar dan gratis en geheel open source. Dat viel helaas een beetje tegen, totdat ik Redmine ontdekte.
Redmine is geschreven in Ruby on Rails en heeft precies wat ik van een project planner verwacht. Er zijn talloze andere open source project planners, maar tot nu toe waren ze of te onhandig, of de Gantt kaart ontbrak.
Redmine heeft behalve de Gantt-kaart ook de mogelijkheid om verschillende gebruikers aan te maken, die taken toebedeeld kunnen krijgen of het project kunnen observeren. Zo kan zelfs een klant dessgewenst de voortgang van een project nauwlettend in de gaten houden. Medewerkers krijgen via email een bericht als hun taak de deadline dreigt te overschrijden en het management krijgt, ook via email, voortgangsrapporten van de medewerkers.
Redmine is dus geen desktop-programma maar draait op een server waardoor er meerdere mensen tegelijk aan kunnen werken. Als u snel wilt beginnen, kunt u ook voor de ‘cloud’ versie kiezen. Daarbij neemt u een abonnement afhankelijk van het aantal projecten en medewerkers en kunt u direkt aan de slag. www.plan.io is zo’n online service die voor een klein maandelijks bedrag de beschikking geeft over een compleet multi-user project planning systeem.
http://plan.io/en/
http://www.redmine.org/
http://tinyurl.com/adgantt
Happy Birthday Linux!
In Augustus 1991, 20 jaar geleden dus, zag linux het licht.
De Finse student Linux Torvalds (20 jaar oud) bedacht dat hij zelf wel een besturingssysteem kon schrijven. Niet omdat dit een mega-succes zou worden, maar gewoon om te leren hoe zo’n systeem in elkaar zit.
Hij baseerde zijn systeem op Minix, een door prof. Tannenbaum ontwikkeld mini-besturingssysteem dat op vele universiteiten gebruikt werd om kersverse studenten kennis te laten maken met de essentiële software voor elke computer.
Linus zette zijn eerste pogingen al gauw op Internet en tot zijn grote verbazing begonnen een aantal andere studenten verbeteringen aan te brengen en die naar hem op te sturen. Linus besloot om een aantal verbeteringen op te nemen in zijn project, en dat dan weer op Internet te zetten. Voor hij het wist werd Linux – want zo noemde hij zijn systeempje – groter en groter, en beter en beter.
In 1992 besloot hij de code onder de GPL te licenseren – dat wil zeggen dat iedereen zijn software kon gebruiken, en alle verbeteringen ook. Al snel werd Linux een echt ‘nerd’ project – dat wil zeggen dat de slimste IT-ers op aarde bijdragen gingen leveren.
In 1996 werd Linus in de dierentuin gebeten door een pinguin en vanaf die dag werd ‘Tux’, de pinguin, de mascotte voor Linux.
In 1998 – na zeven magere jaren – begonnen grote bedrijven zoals IBM interesse te krijgen voor het systeem, dat zowel te gebruiken was in armbandhorloges als in supercomputers.
In 1999 noteerde Red Hat, nog steeds de grootste commerciele Linux distributeur, op de Amerikaanse beurs en in 2003 betaalde IBM zelfs een advertentie tijdens de Superbowl.
In 2011 is 48.3% van alle smartphones uitgerust met een op Linux gebaseerd systeem. Ter vergelijking: Windows 3.1 werd in 1992 uitgebracht. Happy Birthday Linux!
http://www.linuxfoundation.org/20th/
http://tinyurl.com/adlinux
http://liw.fi/linux-anecdotes/
Lulz Security
Het kan u bijna niet ontgaan zijn dat er een groot aantal inbraken is geweest in computersystemen van de amerikaanse overheid. FBI, CIA en de Senaat moesten het allemaal ontgelden de afgelopen maanden.
De veroorzakers waren een groepje ‘ludieke’ crackers, die aan willen tonen dat security, ook bij grote bedrijven en overheidsinstanties, ver te zoeken is.
De inbraken maken bijna allemaal gebruik van botnets, volgens PC Magazine wel tot 2.5 miljoen Windows computers die geïnfecteerd zijn met een virus. De systeembeheerder van Lulzsec kan deze computers commando’s geven, zoals het bombarderen van websites waardoor die kapot gaan of in ieder geval onbereikbaar worden.
Deze aanvallen kunnen uitgevoerd worden doordat er miljoenen slecht beveiligde Windows computers op aarde aanwezig zijn. Deze computers staan vaak op kantoren waar het systeembeheer slecht uitgevoerd wordt, of bij mensen thuis.
Het zou interessant zijn om eens uit te zoeken hoevel Curaçaosche computers in een internationaal botnet zit. Met andere woorden hoeveel cyberaanvallen worden er vanuit Curacao uitgevoerd zonder dat de gebruiker of eigenaar van de PC dat weet.
Helaas zijn er veel gevaarlijker organisaties dan Lulzsec. Het inbreken in de website van de CIA is een heel onschuldig tijdsverdrijf vergeleken met het stelen van miljoenen creditcardgegevens. Dat laatste gebeurt echter steeds meer, en ook hier zijn botnets – geïnfecteerde Windows computers dus – van cruciaal belang.
Nog een stap verder en we praten over ‘cyberwar’. Een prachtig voorbeeld hiervan is Stuxnet, een Windows virus dat heel specifiek bepaalde onderdelen van een Iraanse kerncentrale onklaar maakte.
De hoeveelheid geld, tijd en kennis die in dit virus verwerkt is laat zien dat alleen een grote wereldmacht in staat is zo’n virus te maken en dat virus is dus daadwerkelijk een wapen in een wereldwijde oorlog.
Crackers
In de volksmond worden hackers en crackers vaak door elkaar gehaald.
Hackers zijn vaak scheppend bezig met technologie , terwijl crackers zich bezig houden met computermisdaad.
Bij computermisdaad denkt u misschien aan iemand als Kevin Mitnick, die in de jaren tachtig een flinke gevangenisstraf kreeg voor het inbreken in diverse computersystemen, waaronder die van de overheid.
Het beeld van een langharig individu die vanaf zijn zolderkamer het Pentagon binnendringt, is verleden tijd. Nu is computermisdaad het terrein van goed georganiseerde bendes, compleet met kantoorgebouwen waar tientallen heel erg jonge crackers dagelijks grote aantallen inbraken plegen.
En cybercrime loont, want de meeste slachtoffers gaan nooit naar de politie. Een middelgrote online-winkel, die ‘gecrackt’ is, wil niet in het nieuws komen uit angst voor reputatieschade. Dus betalen ze de crackers een bepaald bedrag om de controle over hun servers weer terug te krijgen. Digitale afpersing dus. En omdat er honderdduizenden middelgrote online winkels zijn, hebben de jonge crackertjes het best druk.
In landen waar de levensstandaard laag is, zijn heel veel slimme jongens en meisjes te vinden die voor een paar Nikes of een Levi de hele week codes kraken. Via Internet kan de hele wereld bereikt worden en meestal zijn sporen ook makkelijker uit te wissen. Daar komt nog bij dat er in dergelijke landen vaak nog helemaal geen cyberwetgeving is en de ‘grote jongens’ meestal vrijuit gaan.
Verreweg de meeste inbraken worden gepleegd via ‘social engineering’ of ‘phishing’, maar ook door computers die makkelijk te besmetten zijn met een virus. De op Open Source gebaseerde besturingssystemen Linux en OSX zijn minder makkelijk te ‘cracken’.
Uiteindelijk is de combinatie van een veilig systeem en alerte en bewuste gebruikers de beste verdediging tegen dit soort aanvallen.
http://tinyurl.com/ad-crack01
http://mitnicksecurity.com
http://www.cybercrimelaw.net
http://tinyurl.com/ad-crack02
Hackers
Wie nu een stukje verwacht over ddos, anonymous en lulzsec komt bedrogen uit. Daar schrijf ik volgende week wel over, onder de titel ‘crackers’.
In de volksmond zijn ‘hackers’ en ‘crackers’ hetzelfde, maar hackers vinden het een belediging om vergeleken te worden met iemand die inbreekt in andermans computers.
Een hacker is beter te vergelijken met een kunstenaar of een uitvinder. Een hacker is iemand die zo enthousiast over computers is dat hij of zij er bijna alles mee kan.
Hackers zijn in de regel programmeurs, maar soms zijn het ook mensen die met hardware werken. Hackers gebruiken techniek waarvoor het niet bedoeld is, en creëren daarmee vaak nieuwe techniek.
Voorbeeld: Johnny Chung Lee wist met stukjes plakband, een paar LEDs en een Wii remote het zelfde effect te bereiken als in de film Minority Report.
Paul Graham beschrijft in zijn essay ‘Hackers and Painters’ dat hacken een creatief proces is en eerder op kunst lijkt dan op wetenschap.
Linus Torvalds, toch wel zo’n beetje de bekendste en meest invloedrijke hacker van deze tijd, beschrijft zichzelf als hacker, behalve tegen ‘gewone’ mensen. “Dan noem ik mezelf liever computer expert of zoiets, zodat ze tenminste het idee hebben dat ze weten wat ik doe”.
Hacken moet je jong leren. Vroeger moest je als kind overal afblijven, zeker als het met techniek te maken had. Nu hebben veel kinderen een eigen computer of telefoon en ze mogen ook aan de CD/DVD speler en andere digitale spullen zitten.
Zo krijg je een groeiende groep ‘hackertjes’ die niet bang zijn voor techniek. En die als het er op aan komt de wereld om zich heen naar hun hand zetten, omdat de wereld om hun heen vol software zit.
http://www.youtube.com/watch?v=0awjPUkBXOU
http://www.paulgraham.com/hp.html
http://www.pavietnam.net/
Daar is Android!
Tien maanden geleden schreef ik over Android, het door Google (mede)ontwikkelde Open Source besturingssysteem voor smartphones. Het viel toen op dat Android geheel afwezig was op de lokale markt.
Tien maanden geleden kocht 27 procent van de mensen die een nieuwe smartphone kochten, een Android. Nu is dat vijftig procent, een groei van 100 procent in ruim 6 maanden. Volgens Nielsen, die deze cijfers publiceerde, is het aandeel RIM (Blackberry) gezakt naar 15 procent en Apple zit – stabiel – op een kwart. Windows Mobile/7 doet in de achterhoede mee met slechts zeven procent.
Waar je op de PC laptop en desktop nog in 89 procent van de gevallen Windows tegen komt, is er in de nieuwe, heel snel groeiende markt van smartphones en tablets nauwelijks Microsoft te bekennen.
Dat zou toch te denken moeten geven, vooral in de opleidingstrajecten. Ook biedt dit vele kansen voor jonge mensen die van techniek houden. In de Apple App Store en op Android Market kom je software tegen van mensen onder de 16, die populair is en soms ook nog flink wat oplevert.
De door het RKCS georganiseerde ‘maak-je-eigen-spel’ wedstrijd is een stap op de goeie weg, al is gekozen voor closed source ontwikkelsoftware.
Intussen is de Android smartphone al wel tegen een schappelijke prijs te koop bij UTS, helaas loopt Digicel hierin een beetje achter. Heel langzaam drijft Curacao ook de moderne wereld in.
http://tinyurl.com/adandroid01
http://tinyurl.com/adandroid02
http://tinyurl.com/adandroid03
http://www.curacao-games.com/